1997年8月28日，东海中学新校舍动工兴建。1998年7月底工程基本竣工。1998年8月13日，新校舍验收交付使用。1998年9月20日，举行了东海中学新校落成仪式。
          1998年秋季开始，盘峙乡初中段义务教育对象全部并入东海中学，不再进行任何形式的分流与借读。
     1998年7月29日，在市电力公司用电管理所召开东海中学第五次董事会，聘请李宗德为东海中学名誉校长，童全杰为东海中学第二任校长，同意设置校董会办公室。
     1998年9月20日，杨詠曼小姐捐赠人民币50万元，设立东海中学奖教奖学、助学基金。2001年12月，正式启用奖教奖学助学基金。
          1998年10月14日，东海中学第一届支委会成立，童全杰为书记，平胞娣、夏召意为支委委员。
          1999年秋季开始，长峙乡东蟹峙村与大猫乡初中被义务教育对象全部并入东海中学，不再进行任何形式的分流与借读。
          2000年2月，东海中学被浙江省人民政府授予“优秀民办学校”。
          2000年3月，东海中学与舟山警备区通信营建立“军民共建”对子。
          2000年6月1日，东海中学女生寝室楼开始动工，2001年6月21日，竣工验收并投入使用。
    2000年9月8日，在东海中学召开第七次董事会，聘请曾时尚为东海中学第三任校长，夏召意为副校长，贝松国为校长助理。
         2000年10月17日，杨詠曼、国家统战部田鹤年副部长来校视察。
    2000年10月23日—25日，市教研室来校进行专题调研。
         2002年8月，经董事会同意，聘请俞金海为东海中学第四任校长。
         2003年10月，东海中学网站建立。2006年10月12日，学校网站改版更新。
         2003年12月，东海中学通过浙江省Ⅱ级民办普通中学验收。
         2004年3月23日，杨詠曼来校亲自参加“杨詠曼奖学助学基金”颁发仪式工。
         2004年4月，东海中学荣誉室建成。
         2004年5月，东海中学小花园内“菁莪亭”建成。
         2004年5月30日，东海中学第一届初中民办班进行招生测试，并于7月5日圆满结束。
         2005年8月，原校名牌“舟山市东海中学（杨羲纪念中学）”改名为“舟山市东海中学杨羲纪念中学”。2005年10月19日，正式挂上新校牌。
         2005年9月30日至10月6日，东海中学部分教师赴香港教育考察。